El Museo Nacional de Historia Natural, fue uno de los primeros Museos del país en tener su propia página web.

En 1999, en trabajo conjunto entre el entonces director de la institución, Lic. Alvaro Mones y Javier González, elaboraron -en mayo de 1999- la primer versión del sitio web del MNHN.

Cabe señalar que entre los años 2003 y 2004, se posicionó entre las 5 páginas más visitadas del MEC.

La misma tuvo varios cambios de estructura y contenidos, destacándose los producidos en 2001, 2003 y 2005, hasta llegar a la web institucional actual.