Se publican desde 1894, e incluyen trabajos de investigación en todas las áreas de las Ciencias Naturales. 

Volumen 1

• Pena, Carlos M. de, (1894). Por vía de introducción.

• Larrañaga, Dámaso A. (1894) (ca. 1819). Memoria geológica sobre la formación del Río de la Plata, deducida de sus conchas fósiles.

• Berg, C. (1894). Descripciones de algunos hemípteros heterópteros nuevos o poco conocidos.

• Arechavaleta, José. (1894). Las gramíneas uruguayas.    parte 1   parte 2    parte 3   parte 4    parte 5   parte 6    parte 7    parte 8    parte 9    parte 10    parte 11    parte 12

• Arechavaleta, José. ; Muller, J (1894). Contribución al conocimiento de los líquenes uruguayos. Lichenes montevidensis.

• Figueira, José H. (1894). Contribución a la fauna uruguaya. Enumeración de mamíferos.

• Arechavaleta, José (1895). Museo Nacional de Montevideo. Reglamento.

   

• Volumen 2

   

• Curci, V. (1896). Estudio sobre un nuevo fermento butyrico.  parte 1    parte 2

• Berro, Mariano B. (1899). La vegetación uruguaya. Plantas que se hacen distinguir por alguna propiedad útil o perjudicial. parte 1    parte 2    parte 3

• André, E. (1899). Géneros Ginerium y Cortaderia.

• André, E. (1899). Sobre nomenclatura botánica hortícola.

• Anónimo. (1899). Reglas de la nomenclatura de los seres organizados adoptadas por los congresos internacionales de zoología.

• Anónimo. (1899). Leyes de la nomenclatura botánica adoptadas en los congresos internacionales de zoología.

• Anónimo. (1899). Géneros de plantas anteriores al año 1891 reformados legalmente según las reglas que sirvieron a Engler para las familias.

• ¿Arechavaleta, J.? (1899). Enumeración de las plantas que recogió el doctor O. Kuntze en esta República.

• Arechavaleta, J. (1899). Contribución al conocimiento de la Flora Uruguaya.

• Baker,? (1899). Monocotiledóneas nuevas del Uruguay.

• Formica Corsi, A. (1900-1901). Moluscos de la República Oriental del Uruguay    parte 1    parte 2    parte 3    parte 4    parte 5.

•                                                                 Volumen 3

• Arechavaleta, José (1898-1901). Flora Uruguaya.   parte 1    parte 2    parte 3    parte 4    parte 5    parte 6    parte 7    parte 8    parte 9    parte 10    parte 11 

•                                                                 Volumen 4

• Arechavaleta, José (1902). Contribución al conocimiento de la flora de la República Uruguaya. Varias especies nuevas y otras poco conocidas.

• ¿Arechavaleta, José.? (1902). Notas sobre la obra de Pritzel: Thesaurus Literaturae Botanicae.

• Arechavaleta, José (1903). Contribución al conocimiento de la vegetación del Uruguay. Algunas especies nuevas y otras poco conocidas.

• Arechavaleta, José (1898). Las gramíneas uruguayas.

• Anónimo. (1903). Reglas de la nomenclatura zoológica adoptadas en el V Congreso Internacional de Zoología (Berlín, 1901).

• Gibert, J. E. (1903). Flora Uruguaya. Nómina vernacularia.

• Arechavaleta, José (1903). Citharexylon barbinerve Cham. y Schecht, tendencia hacia la unisexualidad de sus flores

• Spegazzini, C. (1901). Stipeae platenses.   parte 1    parte 2    parte 3    parte 4    parte 5

• Volumen 5

• Arechavaleta, José (1903-1906). Flora Uruguaya volumen 2. Enumeración y descripción breve de las plantas conocidas hasta hoy y de algunas nuevas que nacen espontáneamente y viven en la República Oriental del Uruguay    parte 1    parte 2    parte 3    parte 4    parte 5    parte 6    parte 7    parte 8    parte 9

• Volumen 6

•  

• Arechavaleta, José (1906). Flora Uruguaya volumen 3   Enumeración y descripción breve de las plantas conocidas hasta hoy y de algunas nuevas que nacen espontáneamente y viven en la República Oriental del Uruguay.   parte 1    parte 2    parte 3    parte 4    parte 5    parte 6    parte 7    parte 8    parte 9   parte 10    parte 11

• Volumen 7 (volumen inconcluso por fallecimiento del autor)

• Arechavaleta, José (1909-1911). Flora Uruguaya. Enumeración y descripción breve de las plantas conocidas hasta hoy y de algunas nuevas que nacen espontáneamente y viven en la República Oriental del Uruguay.    parte 1    parte 2    parte 3    parte 4    parte 5    parte 6

• Anales del Museo Nacional de Montevideo. Sección Histórico-Filosófica

• Azara, Félix de (1904). Geografía física y esférica de las Provincias del Paraguay, y Misiones Guaraníes. Edición y Prólogo de R. R. Schuller.    parte 1    parte 2    parte 3    parte 4    parte 5    parte 6    parte 7    parte 8    parte 9    parte 10    parte 11    parte 12    parte 13   parte 14 

• Schuller, R. R. (1905). Primera contribución al estudio de la Cartografía Americana.  parte 1    parte 2

• Anales del Museo de Historia Natural de Montevideo (Segunda serie)

  Volumen 1

• Arechavaleta, José (1904). Nueva contribución al conocimiento de la flora del Uruguay.

• Arechavaleta, José (1905). Apuntes botánicos.

• Arechavaleta, José (1905). Esclarecimiento sobre algunas cactáceas.

• Arechavaleta, José (1905). Breves apuntes sobre algunas gramíneas de propiedades tóxicas para los herbívoros.

• Arechavaleta, José ; Herter, Guillermo (1911). Vegetación uruguaya. Varias especies nuevas.

• Strohmeyer, H. (1911). Un Platypus del Uruguay.

• Tremoleras, J. (1911). Apuntes lepidopterológicos.

• Devincenzi, Garibaldi J. (1920). Peces del Uruguay.

• Devincenzi, Garibaldi J. (1920). Notas ictiológicas.

• Devincenzi, Garibaldi J. (1920). Extracto de las Memorias Anuales.

• Devincenzi, Garibaldi J. (1924). Peces del Uruguay, II.    parte 1    parte 2    parte 3    parte 4

• Devincenzi, Garibaldi J. (1925). El primer ensayo sobre ictiología del Uruguay. La clase "Peces" de la Zoología de don Dámaso A. Larrañaga.

• Herter, Guillermo ; Osten, Cornelio (1925). Plantae uruguayenses.    parte 1    parte 2

•  

  Volumen 2

• Devincenzi, Garibaldi J (1925). Fauna erpetológica del Uruguay. 

  •    parte 1
  •    parte 2

• Devincenzi, Garibaldi J. (1925). Notas ornitológicas. Observaciones sobre una colección de nidos.

• Osten, Cornelio ; Herter, G. (1925). Plantae uruguayenses. 2-3.

• Devincenzi, Garibaldi J. (1926). Aves del Uruguay. Catálogo descriptivo.   parte 1    parte 2

• Devincenzi, Garibaldi J. (1926). Peces del Uruguay. Notas complementarias.

• Devincenzi, Garibaldi J. ; L. P. Barattini. (1926). Album Ictiológico del Uruguay, I.

• Devincenzi, Garibaldi J. (1927). Aves del Uruguay, II.  parte 1   parte 2

• Castellanos, A. (1927). Descripción de un fragmento de tubo caudal de un nuevo dedicurino en relación con sus géneros afines.

• Osten, C. & G. Herter. (1927). Plantae uruguayenses, 4.

• [Devincenzi, GGaribaldi J.]. (1927). Notas arqueológicas.

• [Devincenzi, GGaribaldi. J.]. (1927). Notas paleontólogicas.

• Devincenzi, Garibaldi. J. (1928). Aves del Uruguay, III. parte 1   parte 2

• Herter, Guillermo. (1928). Los dibujos de plantas de don Dámaso A. Larrañaga.

• Vogelsang, E. G. (1928). El primer ensayo de parasitología platense. Los parásitos de Larrañaga.

• Devincenzi, Garibaldi J. & L. P. Barattini. (1928). Album Ictiológico del Uruguay, II.

•  

  Volumen 3

• Devincenzi, G. J. (1929). Aves del Uruguay, IV.

• Osten, C. y G. Herter. (1929). Plantae uruguayenses, 5.

• Estable, C. (1929). Observaciones sobre algunos insectos del Uruguay.    parte 1    parte 2

• Cordero, E. H. (1929). Contribución al estudio de los dípteros del Uruguay, I.

• Osten, C. (1931). Las ciperáceas del Uruguay.

• [Devincenzi, G. J.]. (1932). El paleontólogo Lucas Kraglievich. Sus trabajos en el Uruguay.

• Kraglievich, L. (1932). Nuevos apuntes para la geología y paleontología uruguayas.    parte 1    parte 2

• Kraglievich, L. (1932). Una gigantesca ave fósil del Uruguay. Devincenzia gallinali n. gen. n. sp., tipo de una nueva familia Devincenziidae del orden Stereornithes.

• Kraglievich, L. (1932). Contribución al conocimiento de los ciervos fósiles del Uruguay.    parte 1    parte 2    parte 3

   

  Volumen 4

• Alvarez, T. (1933). Observaciones biológicas sobre las aves del Uruguay.

• Devincenzi, G. J. (1933). La perpetuación de la especie en los peces sudamericanos.

• Devincenzi, G. J. (1933). Peces del Uruguay. Notas complementarias, II.

• Devincenzi, G. J. (1933). Notas ictiológicas sobre un raro ejemplar del Amazonas (Acanthicus hystrix Spix).

• González, M., M. I. Ardao & A. Lombardo. (1934). Valerianáceas del Uruguay. Sus especies. Algunas consideraciones químico-farmacológicas sobre ellas.

• Rusconi, C. (1934). Observaciones geológicas y nuevos restos de mamíferos fósiles del Uruguay.

• Walther, K. (1935). La estructura geológica de los alrededores de Montevideo.

• Schroeder, J. (1935). La composición química y mineralógica y el valor ténico-industrial de las conchas depositadas en algunos puntos de la costa uruguaya del río de la Plata.

• Walther, K. (1935). El hallazgo en el Uruguay de maclas múltiples de aragonito silicicadas, afines al tipo Molina-Bastennes.

• Devincenzi, G. J. (1935). Mamíferos del Uruguay.  Parte 1    Parte 2     Parte 3

• Legrand, D. (1936). Las mirtáceas del Uruguay.

• Cordero, E. H. (1937). Nerocila fluviatilis y otros isópodos parásitos de las familias Cymothoidae y Bopyridae del Uruguay y del Brasil.

• Devincenzi, G. J. (1939). Peces del Uruguay. Notas complementarias, III.

• Devincenzi, G. J. (1939). Notas ictiológicas sobre peces de la región Patagónica.

• Pereira Fonseca, T. (1939). Argulus vierai n. sp., parásito de Cnesterodon decemmaculatus (Jenyns).

• (16). Mazzoni, R. F. (1937). Sobre hallazgos de supuestas piezas indígenas en los paraderos de José Ignacio y puntas del Chileno (Departamento de Maldonado).

   

• Volumen 5

• Osten, C. (1941). Notas sobre Cactáceas.  parte 1    parte 2    parte 3    parte 4    

• Schweizer, F. & R. G. Webster Kay. (1941). Lepidópteros del Uruguay, I-II.

• Devincenzi, G. J. & G. W. Teague. (1942). Ictiofauna del río Uruguay Medio.    parte 1    parte 2    parte 3

• Devincenzi, G. J. & D. Legrand. (1936-1940). Album ictiológico del Uruguay, 3a. y 4a. series.

•        

•                                                          Volumen 6

• Buen, F. de (1953). La oceanografía frente a las costas del Uruguay.

• Bernasconi, A. (1953). Monografía de los equinoideos argentinos.    parte 1    parte 2    parte 3

• Castellanos, A. (1954). Determinación de las especies de Stromaphoropsis Kragl.

• Muñoa, J. I. (1954). Contribuciones a la antropología física del Uruguay. I. Los primitivos pobladores del Este.

• Acosta y Lara, E. F. (1955). Los chaná-timbúes en la antigua Banda Oriental.

• Schuster, C. (1955). Human figures in South American petroglyphs and pictographs as excerpts from repeating patterns.

• Legrand, C. D. (1959). Comunidades psamófilas de la región de Carrasco (Uruguay).    parte 1    parte 2

•                                                               Volumen 7

• Mañé Garzón, F. (1960). Didymorchis haswelli n. sp. un nuevo Temnocephalida de la cavidad branquial de Parastacus saffordi Faxon.

• Teague, G. W. (1961). The armored sea-robins of America. A revision of the American species of the family Peristediidae.

• Legrand, C. D. (1962). Las especies americanas de Portulaca.    parte 1    parte 2

• Teague, G. W. (1965). Plants of Central Paraguay.

• Ximénez, A., A. Langguth & R. Praderi. (1972). Lista sistemática de los mamíferos del Uruguay.

                                    Anales del Museo Nacional de Historia Natural

• Volumen 8 (tapas)

• 1. Blixen, O. (1992). Los mitos sudamericanos sobre el origen del fuego. Pp. 5-41.

• 2. Osorio, H. S. (1992). Contribución a la flora liquénica del Uruguay. XXV. Pp. 43-70

• 3. Mones, A. & M. E. Philippi. (1992). Bibliografía mastozoológica anotada del Uruguay. Pp. 71-161.

• 4. Klappenbach, M. A. & J. A. Langone. (1992). Lista sistemática y sinonímica de los anfibios del Uruguay. Pp. 163-222.

  Volumen 9

• Mones, A. & M. A. Klappenbach. (1997). Un ilustrado aragonés en el virreinato del Río de la Plata: Félix de Azara (1742-1821). Estudios sobre su vida, su obra y su pensamiento. Pp. 1-231.

  Volumen 10

• 1. Mones, A. (2003). Diversidad de la biota uruguaya. Introducción. Pp. 1-8.

• 2. Capocasale, R. M. (2003). Diversidad de la biota uruguaya. Opiliones. Pp. 1-8.

• 3. Langone, J. A. (2003). Diversidad de la biota uruguaya. Amphibia. Pp. 1-12.

• 4. Mones, A., J. González, R. Praderi & M. Clara. (2003). Diversidad de la biota uruguaya. Mammalia. Pp. 1-28.

• 5. Capocasale, R. M. & A. Pereira. (2003). Diversidad de la biota uruguaya. Araneae. Pp. 1-32.

• 6. Claramunt, S. & J. Cuello. (2004). Diversidad de la biota uruguaya. Aves. Pp. 1-76.